Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRN4Q8WUT4 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
LRRN4Q8WUT4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms