Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PDCD1Q15116 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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