Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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