Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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