Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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CUL1Q13616 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CUL1Q13616 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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CUL1Q13616 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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