Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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