Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms