Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2P78314 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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