Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CENPFP49454 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CENPFP49454 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CENPFP49454 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CENPFP49454 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CENPFP49454 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CENPFP49454 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CENPFP49454 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CENPFP49454 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CENPFP49454 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CENPFP49454 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CENPFP49454 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CENPFP49454 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CENPFP49454 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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