Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms