Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ERVV-1B6SEH8 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ERVV-1B6SEH8 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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