Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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