Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDGFDQ9GZP0 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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