Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL24A1Q17RW2 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms