Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms