Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FSCN1Q16658 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms