Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NREPQ16612 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NREPQ16612 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NREPQ16612 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NREPQ16612 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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NREPQ16612 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NREPQ16612 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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