Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VPS72Q15906 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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