Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNA6Q15825 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms