Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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