Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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