Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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RAB39AQ14964 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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RAB39AQ14964 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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