Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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