Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NPRL3Q12980 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms