Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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