Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNF711-203ENST00000373165 4124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 STXBP5L-208ENST00000497029 3036 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TRBV27-201ENST00000390399 387 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 Z98751.1-201ENST00000413827 381 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC006463.1-201ENST00000445929 232 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SL800P-201ENST00000484823 280 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC104063.1-201ENST00000504840 702 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC098827.1-201ENST00000514630 667 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LINC02321-201ENST00000555975 384 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SL474P-201ENST00000583485 301 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC113143.2-201ENST00000603849 394 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SL575P-201ENST00000620774 299 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CELF2-212ENST00000632728 3827 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNF726-206ENST00000594466 2473 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MFAP5-203ENST00000433590 2308 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TMEM161B-205ENST00000506536 2328 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 L3MBTL3-203ENST00000368139 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PDE1A-203ENST00000409365 2034 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LINC00703-202ENST00000454152 2390 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 KCNA2-215ENST00000640956 1584 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 EIF4BP6-201ENST00000431936 1828 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CTAGE9-201ENST00000314099 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AP005060.1-201ENST00000623868 3174 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 POLR2D-203ENST00000409955 1758 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 GSTA5-202ENST00000370989 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL589763.1-201ENST00000412257 791 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL591896.1-201ENST00000420211 491 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ASS1P11-201ENST00000441309 1216 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SL659P-201ENST00000483093 299 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MICE-207ENST00000510438 1157 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC024022.1-203ENST00000515392 478 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC120193.1-204ENST00000519689 651 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC090079.1-201ENST00000572092 1183 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.98-201ENST00000610878 274 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RFPL3-AS1_1.1-201ENST00000617561 88 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.132-201ENST00000619251 285 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 NBPF6-202ENST00000495380 2494 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms