Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LSSP48449 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LSSP48449 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LSSP48449 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms