Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD13P35453 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD13P35453 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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