Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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