Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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