Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TM6SF1Q9BZW5 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms