Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RNFT2Q96EX2 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms