Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP31Q70CQ4 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms