Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC003965.1-201ENST00000575693 667 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC090774.3-201ENST00000578666 742 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC091982.3-201ENST00000603996 1115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2BB-201ENST00000615966 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC108477.1-201ENST00000636764 526 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RGS17-201ENST00000206262 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 IL4-202ENST00000350025 414 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TMEM127-203ENST00000435268 582 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms