Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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