Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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