Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms