Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms