Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DDX39BQ13838 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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