Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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TCIRG1Q13488 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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