Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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