Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms