Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NME3Q13232 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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