Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SEMA3BQ13214 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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