Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GRIK2Q13002 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms