Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPN13Q12923 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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