Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CENPFP49454 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CENPFP49454 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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