Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms