Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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