Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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